Ferskvandscentret råder over forskellige typer værelser beliggende i flere bygninger. Familie-, dobbelt- og enkeltværelser. Alle værelser har eget bad og toilet, nogle har fransk altandør med udsigt til AQUA parken, Silkeborg søerne samt de flotte skove der omkranser Ferskvandscentret og AQUA.
Priserne er gældende i weekends (fredag til søndag) og i skolernes ferier. Dog tages der forbehold for diverse festivals samt messeperioder, hvor der må påregnes Ferskvandscentrets listepriser.
I ovenstående perioder serveres morgenmaden i Cafe AQUA fra kl. 8.00 til kl. 10.00, ligesom check-ind og check-ud kan foregå i AQUA indenfor åbningstiden på hverdage kl. 10-16 og weekends kl. 10-17. Restaurant og bar i Ferskvandscentret er lukket. Priserne gælder kun overnatning og morgenmad.
Specialpriser for enkelt- , dobbelt,- samt familieværelser:
| Enkeltværelse incl. morgenmad Kr. 525,00 | |
| Dobbeltværelse incl. morgenmad Kr. 825,00 | |
| Opredninger til flere end 2 personer pris pr. person pr. nat Kr. 150,00 | |